Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ErfP70459 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ErfP70459 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ErfP70459 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ErfP70459 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ErfP70459 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ErfP70459 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ErfP70459 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ErfP70459 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ErfP70459 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ErfP70459 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ErfP70459 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ErfP70459 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ErfP70459 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ErfP70459 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ErfP70459 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ErfP70459 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ErfP70459 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ErfP70459 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ErfP70459 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ErfP70459 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ErfP70459 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ErfP70459 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ErfP70459 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ErfP70459 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ErfP70459 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ErfP70459 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ErfP70459 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ErfP70459 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ErfP70459 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ErfP70459 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ErfP70459 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ErfP70459 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ErfP70459 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ErfP70459 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ErfP70459 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ErfP70459 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ErfP70459 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ErfP70459 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ErfP70459 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ErfP70459 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ErfP70459 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ErfP70459 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ErfP70459 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ErfP70459 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ErfP70459 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ErfP70459 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ErfP70459 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ErfP70459 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ErfP70459 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ErfP70459 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ErfP70459 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ErfP70459 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ErfP70459 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ErfP70459 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ErfP70459 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ErfP70459 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ErfP70459 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ErfP70459 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ErfP70459 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ErfP70459 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ErfP70459 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ErfP70459 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ErfP70459 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ErfP70459 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ErfP70459 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ErfP70459 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ErfP70459 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ErfP70459 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ErfP70459 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ErfP70459 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ErfP70459 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ErfP70459 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ErfP70459 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ErfP70459 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ErfP70459 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ErfP70459 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ErfP70459 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ErfP70459 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ErfP70459 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ErfP70459 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ErfP70459 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ErfP70459 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ErfP70459 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ErfP70459 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ErfP70459 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ErfP70459 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ErfP70459 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ErfP70459 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ErfP70459 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ErfP70459 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ErfP70459 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ErfP70459 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ErfP70459 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ErfP70459 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ErfP70459 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ErfP70459 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ErfP70459 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ErfP70459 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ErfP70459 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms