Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actg1P63260 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actg1P63260 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg1P63260 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg1P63260 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg1P63260 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg1P63260 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actg1P63260 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Actg1P63260 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Actg1P63260 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Actg1P63260 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actg1P63260 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actg1P63260 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actg1P63260 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actg1P63260 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actg1P63260 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms