Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp2P63044 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms