Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps27aP62983 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps27aP62983 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps27aP62983 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps27aP62983 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps27aP62983 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps27aP62983 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps27aP62983 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps27aP62983 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps27aP62983 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps27aP62983 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps27aP62983 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps27aP62983 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps27aP62983 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps27aP62983 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps27aP62983 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps27aP62983 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps27aP62983 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps27aP62983 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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