Protein–RNA interactions for Protein: P62900

Rpl31, 60S ribosomal protein L31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl31P62900 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl31P62900 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl31P62900 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl31P62900 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl31P62900 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl31P62900 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl31P62900 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl31P62900 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms