Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhobP62746 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhobP62746 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhobP62746 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhobP62746 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhobP62746 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhobP62746 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhobP62746 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhobP62746 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhobP62746 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhobP62746 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhobP62746 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhobP62746 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhobP62746 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhobP62746 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhobP62746 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhobP62746 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhobP62746 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhobP62746 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhobP62746 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhobP62746 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhobP62746 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhobP62746 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RhobP62746 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhobP62746 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhobP62746 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhobP62746 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhobP62746 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhobP62746 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RhobP62746 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RhobP62746 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RhobP62746 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RhobP62746 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RhobP62746 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RhobP62746 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RhobP62746 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RhobP62746 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RhobP62746 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RhobP62746 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RhobP62746 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhobP62746 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhobP62746 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhobP62746 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhobP62746 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhobP62746 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhobP62746 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RhobP62746 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhobP62746 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhobP62746 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhobP62746 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RhobP62746 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhobP62746 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhobP62746 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhobP62746 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhobP62746 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhobP62746 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhobP62746 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhobP62746 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhobP62746 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhobP62746 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhobP62746 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhobP62746 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhobP62746 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhobP62746 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhobP62746 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhobP62746 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhobP62746 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhobP62746 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhobP62746 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhobP62746 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhobP62746 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhobP62746 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhobP62746 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhobP62746 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhobP62746 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhobP62746 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhobP62746 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhobP62746 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhobP62746 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhobP62746 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhobP62746 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhobP62746 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhobP62746 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhobP62746 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhobP62746 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhobP62746 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhobP62746 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhobP62746 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhobP62746 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhobP62746 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhobP62746 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhobP62746 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhobP62746 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhobP62746 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhobP62746 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhobP62746 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhobP62746 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhobP62746 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhobP62746 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhobP62746 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms