Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acta2P62737 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acta2P62737 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Acta2P62737 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acta2P62737 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta2P62737 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta2P62737 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta2P62737 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta2P62737 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta2P62737 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acta2P62737 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acta2P62737 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acta2P62737 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms