Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl18aP62717 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms