Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou3f4P62515 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms