Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpeP62305 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpeP62305 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms