Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps29P62274 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps29P62274 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps29P62274 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps29P62274 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps29P62274 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps29P62274 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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