Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rims4P60191 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rims4P60191 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rims4P60191 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rims4P60191 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims4P60191 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims4P60191 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms