Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sf3b6P59708 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms