Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P58686 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P58686 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P58686 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P58686 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P58686 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P58686 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P58686 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P58686 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P58686 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P58686 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P58686 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P58686 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P58686 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P58686 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P58686 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P58686 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P58686 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P58686 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P58686 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P58686 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P58686 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P58686 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P58686 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P58686 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P58686 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P58686 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P58686 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P58686 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P58686 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P58686 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P58686 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P58686 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P58686 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P58686 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P58686 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P58686 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P58686 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P58686 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P58686 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P58686 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P58686 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P58686 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P58686 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P58686 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P58686 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P58686 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P58686 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P58686 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P58686 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P58686 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P58686 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P58686 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P58686 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P58686 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P58686 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P58686 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P58686 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P58686 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P58686 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P58686 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P58686 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P58686 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P58686 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P58686 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P58686 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P58686 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P58686 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P58686 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P58686 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P58686 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P58686 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P58686 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P58686 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P58686 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P58686 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P58686 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P58686 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P58686 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P58686 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P58686 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P58686 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P58686 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P58686 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P58686 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P58686 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P58686 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P58686 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P58686 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P58686 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P58686 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P58686 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P58686 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P58686 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P58686 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P58686 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P58686 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P58686 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P58686 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P58686 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms