Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Setd4P58467 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Setd4P58467 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Setd4P58467 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Setd4P58467 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Setd4P58467 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Setd4P58467 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Setd4P58467 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Setd4P58467 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Setd4P58467 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Setd4P58467 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Setd4P58467 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms