Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms