Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bace1P56818 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bace1P56818 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bace1P56818 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Bace1P56818 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bace1P56818 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bace1P56818 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bace1P56818 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bace1P56818 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bace1P56818 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms