Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms