Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctbp2P56546 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.5 ms