Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf5P56477 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf5P56477 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf5P56477 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf5P56477 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf5P56477 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf5P56477 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf5P56477 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf5P56477 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf5P56477 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf5P56477 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf5P56477 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf5P56477 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf5P56477 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf5P56477 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms