Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GferP56213 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GferP56213 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GferP56213 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GferP56213 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GferP56213 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GferP56213 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GferP56213 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GferP56213 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GferP56213 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GferP56213 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GferP56213 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GferP56213 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GferP56213 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GferP56213 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GferP56213 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GferP56213 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GferP56213 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GferP56213 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GferP56213 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GferP56213 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GferP56213 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GferP56213 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GferP56213 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GferP56213 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GferP56213 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GferP56213 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GferP56213 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GferP56213 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GferP56213 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GferP56213 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GferP56213 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GferP56213 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GferP56213 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GferP56213 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GferP56213 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GferP56213 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GferP56213 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GferP56213 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GferP56213 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GferP56213 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GferP56213 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GferP56213 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GferP56213 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GferP56213 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GferP56213 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GferP56213 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GferP56213 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GferP56213 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GferP56213 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GferP56213 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GferP56213 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GferP56213 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GferP56213 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GferP56213 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GferP56213 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GferP56213 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GferP56213 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GferP56213 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GferP56213 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GferP56213 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GferP56213 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GferP56213 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GferP56213 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GferP56213 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GferP56213 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GferP56213 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GferP56213 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GferP56213 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GferP56213 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GferP56213 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GferP56213 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GferP56213 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GferP56213 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GferP56213 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GferP56213 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GferP56213 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GferP56213 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GferP56213 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GferP56213 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GferP56213 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GferP56213 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GferP56213 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GferP56213 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GferP56213 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GferP56213 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GferP56213 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GferP56213 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GferP56213 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GferP56213 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GferP56213 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GferP56213 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GferP56213 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GferP56213 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GferP56213 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GferP56213 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GferP56213 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GferP56213 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GferP56213 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GferP56213 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms