Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrp1P56183 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rrp1P56183 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms