Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CnbpP53996 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CnbpP53996 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CnbpP53996 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CnbpP53996 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CnbpP53996 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CnbpP53996 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms