Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms