Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn1swP51491 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms