Protein–RNA interactions for Protein: P50715

Defa-rs7, Alpha-defensin-related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs7P50715 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa-rs7P50715 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa-rs7P50715 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa-rs7P50715 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa-rs7P50715 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa-rs7P50715 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa-rs7P50715 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs7P50715 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs7P50715 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs7P50715 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs7P50715 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs7P50715 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs7P50715 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs7P50715 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs7P50715 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs7P50715 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs7P50715 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs7P50715 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs7P50715 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs7P50715 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa-rs7P50715 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs7P50715 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs7P50715 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs7P50715 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs7P50715 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs7P50715 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs7P50715 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs7P50715 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs7P50715 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs7P50715 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa-rs7P50715 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa-rs7P50715 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa-rs7P50715 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa-rs7P50715 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa-rs7P50715 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa-rs7P50715 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa-rs7P50715 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa-rs7P50715 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa-rs7P50715 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa-rs7P50715 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa-rs7P50715 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa-rs7P50715 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms