Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FmodP50608 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FmodP50608 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FmodP50608 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FmodP50608 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FmodP50608 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FmodP50608 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FmodP50608 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FmodP50608 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FmodP50608 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FmodP50608 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FmodP50608 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FmodP50608 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FmodP50608 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FmodP50608 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FmodP50608 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FmodP50608 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FmodP50608 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FmodP50608 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FmodP50608 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FmodP50608 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FmodP50608 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FmodP50608 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FmodP50608 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FmodP50608 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FmodP50608 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FmodP50608 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FmodP50608 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FmodP50608 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FmodP50608 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FmodP50608 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FmodP50608 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FmodP50608 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FmodP50608 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FmodP50608 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FmodP50608 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FmodP50608 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FmodP50608 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FmodP50608 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FmodP50608 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FmodP50608 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FmodP50608 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FmodP50608 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FmodP50608 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FmodP50608 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FmodP50608 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FmodP50608 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FmodP50608 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FmodP50608 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FmodP50608 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FmodP50608 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FmodP50608 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FmodP50608 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FmodP50608 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FmodP50608 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FmodP50608 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FmodP50608 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FmodP50608 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FmodP50608 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FmodP50608 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FmodP50608 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FmodP50608 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FmodP50608 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FmodP50608 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FmodP50608 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FmodP50608 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FmodP50608 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FmodP50608 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FmodP50608 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FmodP50608 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FmodP50608 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FmodP50608 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FmodP50608 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FmodP50608 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FmodP50608 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FmodP50608 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FmodP50608 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FmodP50608 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FmodP50608 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FmodP50608 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FmodP50608 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FmodP50608 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FmodP50608 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FmodP50608 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FmodP50608 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FmodP50608 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FmodP50608 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FmodP50608 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FmodP50608 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FmodP50608 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FmodP50608 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FmodP50608 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FmodP50608 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FmodP50608 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FmodP50608 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FmodP50608 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FmodP50608 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FmodP50608 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FmodP50608 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FmodP50608 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms