Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp9P49962 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp9P49962 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp9P49962 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp9P49962 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp9P49962 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp9P49962 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srp9P49962 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srp9P49962 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms