Protein–RNA interactions for Protein: P49764

Pgf, Placenta growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgfP49764 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PgfP49764 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PgfP49764 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PgfP49764 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PgfP49764 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PgfP49764 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PgfP49764 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PgfP49764 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PgfP49764 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PgfP49764 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PgfP49764 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PgfP49764 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PgfP49764 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PgfP49764 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PgfP49764 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PgfP49764 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PgfP49764 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PgfP49764 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PgfP49764 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PgfP49764 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PgfP49764 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PgfP49764 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PgfP49764 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PgfP49764 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PgfP49764 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PgfP49764 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PgfP49764 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PgfP49764 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PgfP49764 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PgfP49764 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PgfP49764 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PgfP49764 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PgfP49764 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PgfP49764 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PgfP49764 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PgfP49764 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PgfP49764 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PgfP49764 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PgfP49764 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PgfP49764 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PgfP49764 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PgfP49764 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PgfP49764 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PgfP49764 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PgfP49764 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PgfP49764 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PgfP49764 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PgfP49764 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PgfP49764 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PgfP49764 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PgfP49764 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PgfP49764 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PgfP49764 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PgfP49764 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PgfP49764 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PgfP49764 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PgfP49764 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PgfP49764 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PgfP49764 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PgfP49764 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PgfP49764 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PgfP49764 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PgfP49764 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PgfP49764 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PgfP49764 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PgfP49764 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PgfP49764 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PgfP49764 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PgfP49764 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PgfP49764 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PgfP49764 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PgfP49764 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PgfP49764 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PgfP49764 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PgfP49764 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PgfP49764 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PgfP49764 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PgfP49764 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PgfP49764 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PgfP49764 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PgfP49764 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PgfP49764 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PgfP49764 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PgfP49764 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PgfP49764 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PgfP49764 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PgfP49764 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PgfP49764 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PgfP49764 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PgfP49764 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PgfP49764 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PgfP49764 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PgfP49764 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PgfP49764 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PgfP49764 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PgfP49764 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PgfP49764 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PgfP49764 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PgfP49764 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PgfP49764 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms