Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CitP49025 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CitP49025 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CitP49025 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CitP49025 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CitP49025 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CitP49025 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CitP49025 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CitP49025 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CitP49025 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CitP49025 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CitP49025 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CitP49025 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CitP49025 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CitP49025 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CitP49025 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CitP49025 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CitP49025 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CitP49025 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CitP49025 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CitP49025 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CitP49025 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CitP49025 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CitP49025 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CitP49025 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CitP49025 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CitP49025 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CitP49025 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CitP49025 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CitP49025 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CitP49025 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CitP49025 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CitP49025 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CitP49025 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CitP49025 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CitP49025 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CitP49025 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CitP49025 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CitP49025 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CitP49025 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CitP49025 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CitP49025 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CitP49025 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CitP49025 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CitP49025 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CitP49025 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CitP49025 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CitP49025 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CitP49025 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CitP49025 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CitP49025 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CitP49025 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CitP49025 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CitP49025 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CitP49025 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CitP49025 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CitP49025 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CitP49025 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CitP49025 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CitP49025 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CitP49025 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CitP49025 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CitP49025 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CitP49025 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CitP49025 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CitP49025 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CitP49025 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CitP49025 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CitP49025 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CitP49025 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CitP49025 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CitP49025 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CitP49025 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CitP49025 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CitP49025 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CitP49025 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CitP49025 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CitP49025 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CitP49025 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CitP49025 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CitP49025 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CitP49025 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CitP49025 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CitP49025 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CitP49025 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CitP49025 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CitP49025 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CitP49025 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CitP49025 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CitP49025 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CitP49025 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CitP49025 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CitP49025 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CitP49025 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CitP49025 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CitP49025 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CitP49025 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CitP49025 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CitP49025 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CitP49025 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms