Protein–RNA interactions for Protein: P47968

Rpia, Ribose-5-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpiaP47968 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RpiaP47968 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpiaP47968 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpiaP47968 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RpiaP47968 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpiaP47968 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpiaP47968 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpiaP47968 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpiaP47968 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpiaP47968 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpiaP47968 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms