Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrprbP47758 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrprbP47758 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrprbP47758 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SrprbP47758 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrprbP47758 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrprbP47758 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrprbP47758 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrprbP47758 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrprbP47758 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrprbP47758 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms