Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax7P47239 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax7P47239 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax7P47239 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax7P47239 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax7P47239 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax7P47239 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pax7P47239 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms