Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms