Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgfrP43117 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms