Protein–RNA interactions for Protein: P42581

Hmx3, Homeobox protein HMX3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx3P42581 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hmx3P42581 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmx3P42581 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms