Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx1-2P42580 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms