Protein–RNA interactions for Protein: P40237

Cd82, CD82 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd82P40237 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd82P40237 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd82P40237 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd82P40237 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd82P40237 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd82P40237 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd82P40237 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd82P40237 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd82P40237 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd82P40237 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd82P40237 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms