Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timp3P39876 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timp3P39876 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timp3P39876 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timp3P39876 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timp3P39876 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms