Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TtlP38585 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TtlP38585 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TtlP38585 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtlP38585 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtlP38585 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtlP38585 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtlP38585 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtlP38585 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtlP38585 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtlP38585 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtlP38585 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtlP38585 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtlP38585 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtlP38585 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtlP38585 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtlP38585 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtlP38585 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtlP38585 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtlP38585 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtlP38585 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtlP38585 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtlP38585 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtlP38585 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TtlP38585 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TtlP38585 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TtlP38585 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TtlP38585 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TtlP38585 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TtlP38585 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TtlP38585 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TtlP38585 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TtlP38585 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TtlP38585 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TtlP38585 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TtlP38585 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TtlP38585 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TtlP38585 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TtlP38585 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TtlP38585 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TtlP38585 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TtlP38585 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TtlP38585 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TtlP38585 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TtlP38585 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TtlP38585 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TtlP38585 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TtlP38585 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TtlP38585 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TtlP38585 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TtlP38585 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TtlP38585 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TtlP38585 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TtlP38585 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TtlP38585 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TtlP38585 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TtlP38585 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TtlP38585 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TtlP38585 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TtlP38585 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TtlP38585 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TtlP38585 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TtlP38585 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TtlP38585 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TtlP38585 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TtlP38585 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TtlP38585 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TtlP38585 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TtlP38585 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TtlP38585 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TtlP38585 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TtlP38585 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TtlP38585 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TtlP38585 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TtlP38585 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TtlP38585 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TtlP38585 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TtlP38585 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TtlP38585 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TtlP38585 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TtlP38585 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TtlP38585 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TtlP38585 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TtlP38585 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TtlP38585 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TtlP38585 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TtlP38585 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TtlP38585 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TtlP38585 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TtlP38585 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TtlP38585 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TtlP38585 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TtlP38585 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TtlP38585 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TtlP38585 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TtlP38585 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TtlP38585 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TtlP38585 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TtlP38585 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TtlP38585 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms