Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig1P37913 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig1P37913 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lig1P37913 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lig1P37913 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lig1P37913 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig1P37913 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lig1P37913 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lig1P37913 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lig1P37913 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig1P37913 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig1P37913 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms