Protein–RNA interactions for Protein: P35979

Rpl12, 60S ribosomal protein L12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl12P35979 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl12P35979 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms