Protein–RNA interactions for Protein: P35918

Kdr, Vascular endothelial growth factor receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdrP35918 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KdrP35918 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KdrP35918 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KdrP35918 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KdrP35918 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KdrP35918 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KdrP35918 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KdrP35918 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KdrP35918 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KdrP35918 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KdrP35918 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KdrP35918 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KdrP35918 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KdrP35918 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KdrP35918 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KdrP35918 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KdrP35918 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KdrP35918 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KdrP35918 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
KdrP35918 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KdrP35918 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KdrP35918 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KdrP35918 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
KdrP35918 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KdrP35918 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KdrP35918 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KdrP35918 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KdrP35918 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KdrP35918 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KdrP35918 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KdrP35918 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KdrP35918 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KdrP35918 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KdrP35918 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KdrP35918 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KdrP35918 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KdrP35918 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KdrP35918 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KdrP35918 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KdrP35918 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KdrP35918 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KdrP35918 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KdrP35918 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KdrP35918 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KdrP35918 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KdrP35918 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KdrP35918 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KdrP35918 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KdrP35918 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KdrP35918 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KdrP35918 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KdrP35918 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KdrP35918 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KdrP35918 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KdrP35918 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KdrP35918 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KdrP35918 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KdrP35918 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KdrP35918 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KdrP35918 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KdrP35918 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KdrP35918 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KdrP35918 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KdrP35918 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KdrP35918 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KdrP35918 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KdrP35918 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KdrP35918 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KdrP35918 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KdrP35918 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KdrP35918 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KdrP35918 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KdrP35918 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KdrP35918 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KdrP35918 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KdrP35918 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KdrP35918 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KdrP35918 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KdrP35918 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KdrP35918 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KdrP35918 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KdrP35918 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KdrP35918 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KdrP35918 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KdrP35918 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KdrP35918 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KdrP35918 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KdrP35918 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KdrP35918 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KdrP35918 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KdrP35918 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KdrP35918 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KdrP35918 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
KdrP35918 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KdrP35918 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KdrP35918 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KdrP35918 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KdrP35918 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KdrP35918 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KdrP35918 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms