Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PtprkP35822 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PtprkP35822 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PtprkP35822 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PtprkP35822 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PtprkP35822 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PtprkP35822 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PtprkP35822 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PtprkP35822 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PtprkP35822 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PtprkP35822 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PtprkP35822 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
PtprkP35822 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PtprkP35822 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms