Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Grin2aP35436 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Grin2aP35436 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms