Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab17P35292 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab17P35292 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab17P35292 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab17P35292 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab17P35292 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab17P35292 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab17P35292 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab17P35292 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab17P35292 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab17P35292 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms