Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5cP35278 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5cP35278 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5cP35278 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rab5cP35278 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rab5cP35278 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rab5cP35278 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rab5cP35278 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5cP35278 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
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