Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sftpa1P35242 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms