Protein–RNA interactions for Protein: P32883

Kras, GTPase KRas, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KrasP32883 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KrasP32883 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KrasP32883 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KrasP32883 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KrasP32883 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KrasP32883 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KrasP32883 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KrasP32883 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KrasP32883 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KrasP32883 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KrasP32883 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KrasP32883 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KrasP32883 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KrasP32883 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KrasP32883 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KrasP32883 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KrasP32883 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KrasP32883 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KrasP32883 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KrasP32883 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KrasP32883 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KrasP32883 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KrasP32883 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KrasP32883 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KrasP32883 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KrasP32883 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KrasP32883 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KrasP32883 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KrasP32883 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KrasP32883 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KrasP32883 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KrasP32883 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KrasP32883 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KrasP32883 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KrasP32883 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KrasP32883 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KrasP32883 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KrasP32883 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KrasP32883 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KrasP32883 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KrasP32883 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KrasP32883 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KrasP32883 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KrasP32883 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KrasP32883 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KrasP32883 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KrasP32883 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KrasP32883 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KrasP32883 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KrasP32883 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KrasP32883 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KrasP32883 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KrasP32883 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KrasP32883 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KrasP32883 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KrasP32883 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KrasP32883 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KrasP32883 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KrasP32883 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KrasP32883 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KrasP32883 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KrasP32883 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KrasP32883 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KrasP32883 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KrasP32883 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KrasP32883 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KrasP32883 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KrasP32883 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KrasP32883 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KrasP32883 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KrasP32883 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KrasP32883 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KrasP32883 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KrasP32883 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KrasP32883 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KrasP32883 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KrasP32883 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KrasP32883 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KrasP32883 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KrasP32883 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KrasP32883 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KrasP32883 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KrasP32883 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KrasP32883 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KrasP32883 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KrasP32883 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KrasP32883 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KrasP32883 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KrasP32883 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KrasP32883 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KrasP32883 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KrasP32883 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KrasP32883 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KrasP32883 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KrasP32883 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KrasP32883 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KrasP32883 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KrasP32883 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KrasP32883 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KrasP32883 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms