Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SsbP32067 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SsbP32067 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SsbP32067 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SsbP32067 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SsbP32067 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SsbP32067 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SsbP32067 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SsbP32067 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SsbP32067 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SsbP32067 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SsbP32067 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SsbP32067 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SsbP32067 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SsbP32067 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SsbP32067 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SsbP32067 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SsbP32067 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SsbP32067 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SsbP32067 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SsbP32067 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SsbP32067 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SsbP32067 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SsbP32067 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SsbP32067 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SsbP32067 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SsbP32067 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SsbP32067 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SsbP32067 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SsbP32067 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SsbP32067 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SsbP32067 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SsbP32067 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SsbP32067 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SsbP32067 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SsbP32067 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SsbP32067 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SsbP32067 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SsbP32067 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SsbP32067 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SsbP32067 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SsbP32067 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SsbP32067 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SsbP32067 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SsbP32067 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SsbP32067 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SsbP32067 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SsbP32067 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SsbP32067 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SsbP32067 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SsbP32067 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SsbP32067 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SsbP32067 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SsbP32067 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SsbP32067 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SsbP32067 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SsbP32067 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SsbP32067 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SsbP32067 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SsbP32067 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SsbP32067 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SsbP32067 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SsbP32067 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SsbP32067 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SsbP32067 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SsbP32067 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SsbP32067 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SsbP32067 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SsbP32067 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SsbP32067 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SsbP32067 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SsbP32067 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SsbP32067 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SsbP32067 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SsbP32067 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SsbP32067 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SsbP32067 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SsbP32067 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SsbP32067 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SsbP32067 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SsbP32067 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SsbP32067 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SsbP32067 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SsbP32067 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SsbP32067 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SsbP32067 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SsbP32067 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SsbP32067 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SsbP32067 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SsbP32067 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SsbP32067 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SsbP32067 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SsbP32067 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SsbP32067 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SsbP32067 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SsbP32067 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SsbP32067 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SsbP32067 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SsbP32067 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SsbP32067 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms