Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctnnd1P30999 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms